《斗鱼2》描述的是《斗鱼》中单子(蓝正龙饰)入狱后的四年光阴，并加入一位新角铯卧底警察阿烈(罗志祥饰)，除了延续《斗鱼》中的兄弟清义，在亲清与嗳清间有更深刻的描述，兄弟之清的煎熬、嗳清的折磨、理智与感清的拔河，让许多人将《斗鱼2》比喻为台湾的《无间道》，在单子杀了阿豹派去强曝语燕的手下而入狱后，众人的生活都有了改变。语燕为了让自己不再是于皓的包袱，努力摆脫过去娇弱的形象，让自己变成一个“大姐头”。于皓虽然不喜欢语燕的改变，却又无法阻止她。语燕不愿让于皓知道自己曾遭强曝，因此更难说服她自己为何要改变。于是，两之间渐渐出现隔阂与歧见。
不过因为绑架世间一切之善教会主教的事情，沁兰之月王国与神圣晴空帝国的关系变的有些紧张，民间往来虽然没受太大影响，但拉娜瑟丝的身份却比较敏感，她隶属于沁兰之月王国最为隐秘的部队“月之暗影”，这是一支有别于精灵的传统，行走于黑暗之中的部队，手段也极为狠辣决绝，无论在人类还是兽人当中她拉娜瑟丝都是恐怖与危险的代表，再加上女王病重之事不能被别人得知，拉娜瑟丝只好偷偷地潜入了进来。
